Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RPTNQ6XPR3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPTNQ6XPR3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPTNQ6XPR3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms