Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NOM1Q5C9Z4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NOM1Q5C9Z4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NOM1Q5C9Z4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms