Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC27Q2M243 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC27Q2M243 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCDC27Q2M243 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms