Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NECTIN1Q15223 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
NECTIN1Q15223 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
NECTIN1Q15223 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
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