Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTB1Q13884 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SNTB1Q13884 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNTB1Q13884 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SNTB1Q13884 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTB1Q13884 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTB1Q13884 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTB1Q13884 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTB1Q13884 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTB1Q13884 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTB1Q13884 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTB1Q13884 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SNTB1Q13884 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTB1Q13884 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTB1Q13884 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTB1Q13884 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTB1Q13884 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNTB1Q13884 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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