Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CLTCL1P53675 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CLTCL1P53675 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLTCL1P53675 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLTCL1P53675 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLTCL1P53675 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLTCL1P53675 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLTCL1P53675 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLTCL1P53675 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLTCL1P53675 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLTCL1P53675 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLTCL1P53675 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLTCL1P53675 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CLTCL1P53675 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms