Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MAGEA4P43358 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEA4P43358 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms