Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKHD1P08F94 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PKHD1P08F94 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKHD1P08F94 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PKHD1P08F94 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PKHD1P08F94 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PKHD1P08F94 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PKHD1P08F94 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKHD1P08F94 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKHD1P08F94 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKHD1P08F94 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PKHD1P08F94 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKHD1P08F94 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKHD1P08F94 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKHD1P08F94 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PKHD1P08F94 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PKHD1P08F94 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKHD1P08F94 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKHD1P08F94 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PKHD1P08F94 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PKHD1P08F94 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PKHD1P08F94 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKHD1P08F94 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKHD1P08F94 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PKHD1P08F94 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKHD1P08F94 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PKHD1P08F94 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PKHD1P08F94 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PKHD1P08F94 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PKHD1P08F94 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PKHD1P08F94 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKHD1P08F94 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PKHD1P08F94 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PKHD1P08F94 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKHD1P08F94 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKHD1P08F94 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PKHD1P08F94 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKHD1P08F94 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PKHD1P08F94 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKHD1P08F94 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKHD1P08F94 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKHD1P08F94 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PKHD1P08F94 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PKHD1P08F94 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PKHD1P08F94 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PKHD1P08F94 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKHD1P08F94 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PKHD1P08F94 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKHD1P08F94 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKHD1P08F94 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PKHD1P08F94 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKHD1P08F94 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PKHD1P08F94 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PKHD1P08F94 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKHD1P08F94 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PKHD1P08F94 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKHD1P08F94 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKHD1P08F94 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PKHD1P08F94 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKHD1P08F94 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PKHD1P08F94 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PKHD1P08F94 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PKHD1P08F94 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKHD1P08F94 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKHD1P08F94 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKHD1P08F94 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PKHD1P08F94 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKHD1P08F94 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PKHD1P08F94 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PKHD1P08F94 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PKHD1P08F94 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKHD1P08F94 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PKHD1P08F94 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKHD1P08F94 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PKHD1P08F94 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKHD1P08F94 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PKHD1P08F94 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKHD1P08F94 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKHD1P08F94 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKHD1P08F94 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKHD1P08F94 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PKHD1P08F94 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PKHD1P08F94 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKHD1P08F94 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PKHD1P08F94 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKHD1P08F94 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PKHD1P08F94 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKHD1P08F94 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PKHD1P08F94 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKHD1P08F94 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PKHD1P08F94 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKHD1P08F94 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PKHD1P08F94 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKHD1P08F94 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PKHD1P08F94 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PKHD1P08F94 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PKHD1P08F94 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms