Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BNIP3LO60238 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BNIP3LO60238 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms