Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QQQ9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QQQ9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QQQ9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QQQ9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QQQ9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QQQ9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
J3QQQ9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
J3QQQ9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QQQ9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QQQ9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QQQ9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QQQ9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QQQ9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QQQ9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QQQ9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QQQ9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QQQ9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QQQ9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QQQ9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QQQ9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QQQ9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QQQ9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QQQ9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QQQ9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QQQ9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QQQ9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
J3QQQ9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QQQ9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QQQ9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QQQ9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QQQ9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QQQ9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QQQ9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QQQ9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
J3QQQ9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QQQ9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QQQ9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QQQ9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QQQ9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QQQ9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QQQ9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QQQ9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QQQ9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QQQ9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QQQ9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QQQ9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QQQ9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QQQ9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QQQ9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
J3QQQ9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QQQ9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QQQ9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QQQ9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QQQ9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QQQ9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QQQ9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QQQ9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
J3QQQ9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QQQ9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QQQ9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QQQ9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QQQ9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QQQ9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QQQ9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QQQ9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QQQ9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QQQ9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QQQ9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QQQ9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QQQ9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QQQ9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QQQ9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QQQ9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QQQ9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
J3QQQ9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QQQ9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QQQ9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QQQ9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QQQ9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QQQ9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QQQ9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
J3QQQ9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
J3QQQ9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
J3QQQ9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
J3QQQ9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QQQ9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QQQ9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QQQ9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QQQ9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QQQ9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QQQ9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QQQ9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QQQ9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QQQ9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QQQ9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
J3QQQ9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QQQ9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QQQ9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
J3QQQ9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms