Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BHMG1C9JSJ3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BHMG1C9JSJ3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms