Protein–RNA interactions for Protein: A9Z1Z3

FER1L4, Fer-1-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FER1L4A9Z1Z3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
FER1L4A9Z1Z3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FER1L4A9Z1Z3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FER1L4A9Z1Z3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FER1L4A9Z1Z3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms