Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GOLGA6L4A6NEF3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GOLGA6L4A6NEF3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GOLGA6L4A6NEF3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms