Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP69A5D8W1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP69A5D8W1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP69A5D8W1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP69A5D8W1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP69A5D8W1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFAP69A5D8W1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFAP69A5D8W1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms