Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YX44

TRBV5-5, T-cell receptor beta variable 5-5 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-5A0A0J9YX44 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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TRBV5-5A0A0J9YX44 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV5-5A0A0J9YX44 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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TRBV5-5A0A0J9YX44 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV5-5A0A0J9YX44 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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TRBV5-5A0A0J9YX44 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV5-5A0A0J9YX44 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV5-5A0A0J9YX44 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV5-5A0A0J9YX44 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV5-5A0A0J9YX44 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV5-5A0A0J9YX44 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV5-5A0A0J9YX44 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV5-5A0A0J9YX44 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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TRBV5-5A0A0J9YX44 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV5-5A0A0J9YX44 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV5-5A0A0J9YX44 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV5-5A0A0J9YX44 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV5-5A0A0J9YX44 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV5-5A0A0J9YX44 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV5-5A0A0J9YX44 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRBV5-5A0A0J9YX44 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRBV5-5A0A0J9YX44 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRBV5-5A0A0J9YX44 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRBV5-5A0A0J9YX44 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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