Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VPREB3Q9UKI3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VPREB3Q9UKI3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VPREB3Q9UKI3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms