Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
USP35Q9P2H5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC31.37■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
USP35Q9P2H5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
USP35Q9P2H5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
USP35Q9P2H5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243 ms