Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NECAP2Q9NVZ3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NECAP2Q9NVZ3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NECAP2Q9NVZ3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms