Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PAPOLBQ9NRJ5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PAPOLBQ9NRJ5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms