Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG7

SDR39U1, Epimerase family protein SDR39U1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR39U1Q9NRG7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SDR39U1Q9NRG7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDR39U1Q9NRG7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDR39U1Q9NRG7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDR39U1Q9NRG7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDR39U1Q9NRG7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDR39U1Q9NRG7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDR39U1Q9NRG7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms