Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPCDR1Q9BY65 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPCDR1Q9BY65 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPCDR1Q9BY65 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPCDR1Q9BY65 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPCDR1Q9BY65 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPCDR1Q9BY65 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPCDR1Q9BY65 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPCDR1Q9BY65 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPCDR1Q9BY65 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPCDR1Q9BY65 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPCDR1Q9BY65 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPCDR1Q9BY65 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NPCDR1Q9BY65 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NPCDR1Q9BY65 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NPCDR1Q9BY65 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NPCDR1Q9BY65 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NPCDR1Q9BY65 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NPCDR1Q9BY65 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NPCDR1Q9BY65 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms