Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMED9Q9BVK6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMED9Q9BVK6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED9Q9BVK6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms