Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SORCS2Q96PQ0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SORCS2Q96PQ0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SORCS2Q96PQ0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SORCS2Q96PQ0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SORCS2Q96PQ0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SORCS2Q96PQ0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SORCS2Q96PQ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SORCS2Q96PQ0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SORCS2Q96PQ0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SORCS2Q96PQ0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SORCS2Q96PQ0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SORCS2Q96PQ0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SORCS2Q96PQ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SORCS2Q96PQ0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SORCS2Q96PQ0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SORCS2Q96PQ0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SORCS2Q96PQ0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SORCS2Q96PQ0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SORCS2Q96PQ0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms