Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CNBD2Q96M20 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNBD2Q96M20 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms