Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CKAP2Q8WWK9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKAP2Q8WWK9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKAP2Q8WWK9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKAP2Q8WWK9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKAP2Q8WWK9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CKAP2Q8WWK9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP2Q8WWK9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP2Q8WWK9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP2Q8WWK9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP2Q8WWK9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP2Q8WWK9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP2Q8WWK9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP2Q8WWK9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP2Q8WWK9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP2Q8WWK9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP2Q8WWK9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP2Q8WWK9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP2Q8WWK9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CKAP2Q8WWK9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKAP2Q8WWK9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKAP2Q8WWK9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKAP2Q8WWK9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKAP2Q8WWK9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CKAP2Q8WWK9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CKAP2Q8WWK9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms