Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGA4Q8IV77 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGA4Q8IV77 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGA4Q8IV77 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms