Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CNGA4Q8IV77 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CNGA4Q8IV77 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CNGA4Q8IV77 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CNGA4Q8IV77 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
CNGA4Q8IV77 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
CNGA4Q8IV77 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CNGA4Q8IV77 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CNGA4Q8IV77 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CNGA4Q8IV77 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CNGA4Q8IV77 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CNGA4Q8IV77 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CNGA4Q8IV77 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CNGA4Q8IV77 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CNGA4Q8IV77 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CNGA4Q8IV77 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CNGA4Q8IV77 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CNGA4Q8IV77 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CNGA4Q8IV77 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CNGA4Q8IV77 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CNGA4Q8IV77 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CNGA4Q8IV77 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CNGA4Q8IV77 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CNGA4Q8IV77 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CNGA4Q8IV77 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CNGA4Q8IV77 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CNGA4Q8IV77 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CNGA4Q8IV77 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CNGA4Q8IV77 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CNGA4Q8IV77 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CNGA4Q8IV77 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CNGA4Q8IV77 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CNGA4Q8IV77 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CNGA4Q8IV77 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CNGA4Q8IV77 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CNGA4Q8IV77 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CNGA4Q8IV77 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CNGA4Q8IV77 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CNGA4Q8IV77 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CNGA4Q8IV77 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CNGA4Q8IV77 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CNGA4Q8IV77 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CNGA4Q8IV77 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CNGA4Q8IV77 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CNGA4Q8IV77 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CNGA4Q8IV77 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CNGA4Q8IV77 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CNGA4Q8IV77 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
CNGA4Q8IV77 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CNGA4Q8IV77 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CNGA4Q8IV77 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CNGA4Q8IV77 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CNGA4Q8IV77 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CNGA4Q8IV77 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CNGA4Q8IV77 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CNGA4Q8IV77 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CNGA4Q8IV77 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CNGA4Q8IV77 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CNGA4Q8IV77 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CNGA4Q8IV77 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CNGA4Q8IV77 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CNGA4Q8IV77 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CNGA4Q8IV77 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CNGA4Q8IV77 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CNGA4Q8IV77 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CNGA4Q8IV77 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CNGA4Q8IV77 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CNGA4Q8IV77 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CNGA4Q8IV77 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CNGA4Q8IV77 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CNGA4Q8IV77 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CNGA4Q8IV77 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CNGA4Q8IV77 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CNGA4Q8IV77 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CNGA4Q8IV77 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CNGA4Q8IV77 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CNGA4Q8IV77 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CNGA4Q8IV77 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CNGA4Q8IV77 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CNGA4Q8IV77 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CNGA4Q8IV77 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CNGA4Q8IV77 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CNGA4Q8IV77 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CNGA4Q8IV77 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CNGA4Q8IV77 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CNGA4Q8IV77 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CNGA4Q8IV77 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CNGA4Q8IV77 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
CNGA4Q8IV77 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CNGA4Q8IV77 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CNGA4Q8IV77 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CNGA4Q8IV77 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CNGA4Q8IV77 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CNGA4Q8IV77 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CNGA4Q8IV77 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CNGA4Q8IV77 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CNGA4Q8IV77 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CNGA4Q8IV77 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CNGA4Q8IV77 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CNGA4Q8IV77 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms