Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
STRCQ7RTU9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
STRCQ7RTU9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
STRCQ7RTU9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms