Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSSK4Q6SA08 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSSK4Q6SA08 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSSK4Q6SA08 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms