Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
NEDD8Q15843 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEDD8Q15843 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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