Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TAF1CQ15572 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TAF1CQ15572 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TAF1CQ15572 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
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