Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MKRN4PQ13434 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKRN4PQ13434 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKRN4PQ13434 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms