Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB15P59190 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB15P59190 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB15P59190 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB15P59190 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB15P59190 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB15P59190 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB15P59190 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB15P59190 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB15P59190 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB15P59190 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB15P59190 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB15P59190 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB15P59190 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB15P59190 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB15P59190 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB15P59190 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB15P59190 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB15P59190 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB15P59190 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB15P59190 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB15P59190 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB15P59190 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB15P59190 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB15P59190 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB15P59190 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB15P59190 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB15P59190 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB15P59190 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB15P59190 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB15P59190 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB15P59190 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB15P59190 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB15P59190 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB15P59190 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB15P59190 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB15P59190 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB15P59190 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB15P59190 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB15P59190 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB15P59190 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RAB15P59190 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB15P59190 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB15P59190 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB15P59190 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB15P59190 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB15P59190 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB15P59190 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB15P59190 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB15P59190 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB15P59190 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB15P59190 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB15P59190 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB15P59190 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB15P59190 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB15P59190 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB15P59190 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB15P59190 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB15P59190 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB15P59190 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB15P59190 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB15P59190 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB15P59190 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB15P59190 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB15P59190 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB15P59190 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB15P59190 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB15P59190 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB15P59190 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB15P59190 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB15P59190 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB15P59190 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB15P59190 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB15P59190 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB15P59190 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB15P59190 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB15P59190 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB15P59190 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB15P59190 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB15P59190 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB15P59190 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB15P59190 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB15P59190 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB15P59190 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB15P59190 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB15P59190 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB15P59190 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB15P59190 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB15P59190 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB15P59190 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB15P59190 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB15P59190 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB15P59190 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB15P59190 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB15P59190 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB15P59190 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB15P59190 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB15P59190 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB15P59190 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB15P59190 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms