Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GTF2A2P52657 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2A2P52657 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GTF2A2P52657 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2A2P52657 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms