Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NF2P35240 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NF2P35240 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NF2P35240 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NF2P35240 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NF2P35240 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NF2P35240 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NF2P35240 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NF2P35240 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NF2P35240 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NF2P35240 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NF2P35240 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NF2P35240 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NF2P35240 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NF2P35240 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NF2P35240 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NF2P35240 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NF2P35240 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NF2P35240 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NF2P35240 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NF2P35240 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NF2P35240 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NF2P35240 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NF2P35240 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NF2P35240 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NF2P35240 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NF2P35240 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NF2P35240 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NF2P35240 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NF2P35240 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NF2P35240 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NF2P35240 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NF2P35240 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NF2P35240 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NF2P35240 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NF2P35240 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NF2P35240 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NF2P35240 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NF2P35240 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NF2P35240 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NF2P35240 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NF2P35240 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NF2P35240 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NF2P35240 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NF2P35240 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NF2P35240 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NF2P35240 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NF2P35240 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NF2P35240 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NF2P35240 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NF2P35240 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NF2P35240 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NF2P35240 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NF2P35240 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NF2P35240 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NF2P35240 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NF2P35240 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NF2P35240 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NF2P35240 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NF2P35240 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
NF2P35240 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NF2P35240 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NF2P35240 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NF2P35240 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NF2P35240 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NF2P35240 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NF2P35240 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NF2P35240 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NF2P35240 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NF2P35240 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NF2P35240 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NF2P35240 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NF2P35240 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NF2P35240 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NF2P35240 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NF2P35240 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NF2P35240 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NF2P35240 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NF2P35240 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NF2P35240 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NF2P35240 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NF2P35240 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NF2P35240 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NF2P35240 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NF2P35240 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NF2P35240 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NF2P35240 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NF2P35240 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NF2P35240 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NF2P35240 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NF2P35240 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NF2P35240 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NF2P35240 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NF2P35240 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NF2P35240 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NF2P35240 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NF2P35240 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NF2P35240 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NF2P35240 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NF2P35240 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.1 ms