Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HOXA10P31260 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXA10P31260 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXA10P31260 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.7 ms