Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHGAP10645 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHGAP10645 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHGAP10645 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CHGAP10645 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHGAP10645 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHGAP10645 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHGAP10645 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHGAP10645 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHGAP10645 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHGAP10645 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHGAP10645 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHGAP10645 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHGAP10645 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHGAP10645 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHGAP10645 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHGAP10645 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHGAP10645 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHGAP10645 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHGAP10645 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHGAP10645 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHGAP10645 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHGAP10645 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHGAP10645 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CHGAP10645 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHGAP10645 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHGAP10645 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHGAP10645 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHGAP10645 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHGAP10645 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHGAP10645 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHGAP10645 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHGAP10645 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHGAP10645 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CHGAP10645 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CHGAP10645 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CHGAP10645 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CHGAP10645 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CHGAP10645 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CHGAP10645 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CHGAP10645 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CHGAP10645 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CHGAP10645 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
CHGAP10645 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CHGAP10645 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
CHGAP10645 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CHGAP10645 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
CHGAP10645 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CHGAP10645 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CHGAP10645 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CHGAP10645 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CHGAP10645 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CHGAP10645 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CHGAP10645 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CHGAP10645 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CHGAP10645 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CHGAP10645 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHGAP10645 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHGAP10645 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHGAP10645 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHGAP10645 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHGAP10645 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHGAP10645 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CHGAP10645 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CHGAP10645 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CHGAP10645 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CHGAP10645 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CHGAP10645 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CHGAP10645 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CHGAP10645 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHGAP10645 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHGAP10645 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHGAP10645 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHGAP10645 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CHGAP10645 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHGAP10645 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHGAP10645 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHGAP10645 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHGAP10645 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHGAP10645 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHGAP10645 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CHGAP10645 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
CHGAP10645 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
CHGAP10645 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHGAP10645 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHGAP10645 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
CHGAP10645 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHGAP10645 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHGAP10645 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHGAP10645 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHGAP10645 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHGAP10645 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHGAP10645 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHGAP10645 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHGAP10645 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHGAP10645 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHGAP10645 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHGAP10645 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHGAP10645 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CHGAP10645 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms