Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIOO75962 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIOO75962 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIOO75962 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIOO75962 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIOO75962 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIOO75962 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIOO75962 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIOO75962 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIOO75962 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIOO75962 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIOO75962 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIOO75962 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIOO75962 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIOO75962 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIOO75962 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIOO75962 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIOO75962 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIOO75962 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIOO75962 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIOO75962 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIOO75962 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIOO75962 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIOO75962 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIOO75962 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIOO75962 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIOO75962 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIOO75962 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIOO75962 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIOO75962 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIOO75962 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIOO75962 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIOO75962 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIOO75962 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIOO75962 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIOO75962 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIOO75962 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIOO75962 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIOO75962 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIOO75962 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIOO75962 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIOO75962 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIOO75962 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIOO75962 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIOO75962 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIOO75962 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIOO75962 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIOO75962 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIOO75962 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIOO75962 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIOO75962 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIOO75962 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIOO75962 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIOO75962 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIOO75962 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIOO75962 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIOO75962 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIOO75962 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIOO75962 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIOO75962 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIOO75962 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIOO75962 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIOO75962 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIOO75962 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIOO75962 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIOO75962 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIOO75962 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIOO75962 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIOO75962 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIOO75962 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIOO75962 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIOO75962 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIOO75962 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIOO75962 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIOO75962 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIOO75962 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIOO75962 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIOO75962 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIOO75962 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIOO75962 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIOO75962 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIOO75962 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIOO75962 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIOO75962 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIOO75962 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIOO75962 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIOO75962 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIOO75962 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIOO75962 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIOO75962 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIOO75962 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIOO75962 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIOO75962 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIOO75962 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIOO75962 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIOO75962 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIOO75962 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIOO75962 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIOO75962 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIOO75962 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms