Protein–RNA interactions for Protein: O75751

SLC22A3, Solute carrier family 22 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A3O75751 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A3O75751 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A3O75751 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A3O75751 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A3O75751 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A3O75751 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A3O75751 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A3O75751 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A3O75751 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A3O75751 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A3O75751 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A3O75751 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A3O75751 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A3O75751 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A3O75751 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A3O75751 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A3O75751 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A3O75751 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A3O75751 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A3O75751 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A3O75751 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC22A3O75751 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC22A3O75751 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC22A3O75751 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms