Protein–RNA interactions for Protein: H7C0S8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0S8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H7C0S8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C0S8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C0S8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C0S8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C0S8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C0S8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C0S8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C0S8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H7C0S8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C0S8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C0S8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C0S8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C0S8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C0S8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C0S8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C0S8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C0S8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C0S8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C0S8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
H7C0S8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H7C0S8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H7C0S8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H7C0S8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
H7C0S8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H7C0S8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
H7C0S8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H7C0S8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H7C0S8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H7C0S8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H7C0S8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C0S8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C0S8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C0S8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C0S8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C0S8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C0S8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C0S8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
H7C0S8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C0S8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C0S8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C0S8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C0S8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C0S8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C0S8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C0S8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H7C0S8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C0S8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C0S8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C0S8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C0S8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C0S8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C0S8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C0S8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C0S8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H7C0S8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
H7C0S8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H7C0S8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H7C0S8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H7C0S8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H7C0S8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H7C0S8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H7C0S8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H7C0S8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H7C0S8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H7C0S8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H7C0S8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H7C0S8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H7C0S8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H7C0S8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H7C0S8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H7C0S8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H7C0S8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H7C0S8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H7C0S8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H7C0S8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H7C0S8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
H7C0S8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H7C0S8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H7C0S8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H7C0S8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H7C0S8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H7C0S8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H7C0S8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H7C0S8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H7C0S8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H7C0S8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
H7C0S8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H7C0S8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H7C0S8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H7C0S8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H7C0S8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H7C0S8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H7C0S8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H7C0S8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H7C0S8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H7C0S8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H7C0S8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H7C0S8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H7C0S8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms