Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C5orf49A4QMS7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C5orf49A4QMS7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C5orf49A4QMS7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C5orf49A4QMS7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C5orf49A4QMS7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C5orf49A4QMS7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C5orf49A4QMS7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C5orf49A4QMS7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C5orf49A4QMS7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C5orf49A4QMS7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C5orf49A4QMS7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C5orf49A4QMS7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C5orf49A4QMS7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms