Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSR3Q9UJK0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSR3Q9UJK0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1575.1 ms