Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NKIRAS2Q9NYR9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NKIRAS2Q9NYR9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NKIRAS2Q9NYR9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
NKIRAS2Q9NYR9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms