Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8M2

BRD9, Bromodomain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD9Q9H8M2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD9Q9H8M2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD9Q9H8M2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRD9Q9H8M2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRD9Q9H8M2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRD9Q9H8M2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRD9Q9H8M2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRD9Q9H8M2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRD9Q9H8M2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRD9Q9H8M2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRD9Q9H8M2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRD9Q9H8M2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BRD9Q9H8M2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD9Q9H8M2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD9Q9H8M2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD9Q9H8M2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD9Q9H8M2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD9Q9H8M2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD9Q9H8M2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD9Q9H8M2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD9Q9H8M2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD9Q9H8M2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD9Q9H8M2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD9Q9H8M2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRD9Q9H8M2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms