Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUDS3Q9H7L9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SUDS3Q9H7L9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SUDS3Q9H7L9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms