Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMAD5Q99717 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMAD5Q99717 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms