Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SCAF11Q99590 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SCAF11Q99590 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SCAF11Q99590 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SCAF11Q99590 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SCAF11Q99590 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SCAF11Q99590 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SCAF11Q99590 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SCAF11Q99590 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SCAF11Q99590 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SCAF11Q99590 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SCAF11Q99590 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SCAF11Q99590 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms