Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RUFY1Q96T51 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RUFY1Q96T51 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms