Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q96MF0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q96MF0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q96MF0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q96MF0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Q96MF0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q96MF0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q96MF0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Q96MF0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q96MF0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q96MF0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Q96MF0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q96MF0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q96MF0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q96MF0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q96MF0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Q96MF0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Q96MF0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q96MF0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q96MF0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q96MF0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q96MF0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Q96MF0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q96MF0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q96MF0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q96MF0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q96MF0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Q96MF0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Q96MF0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Q96MF0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Q96MF0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q96MF0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q96MF0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q96MF0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Q96MF0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q96MF0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q96MF0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q96MF0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q96MF0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q96MF0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q96MF0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q96MF0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q96MF0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q96MF0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q96MF0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q96MF0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q96MF0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q96MF0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q96MF0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Q96MF0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Q96MF0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q96MF0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q96MF0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q96MF0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q96MF0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q96MF0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Q96MF0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q96MF0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q96MF0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q96MF0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q96MF0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q96MF0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q96MF0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q96MF0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q96MF0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q96MF0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q96MF0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q96MF0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q96MF0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q96MF0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q96MF0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q96MF0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q96MF0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q96MF0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q96MF0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q96MF0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q96MF0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q96MF0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Q96MF0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Q96MF0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Q96MF0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Q96MF0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Q96MF0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q96MF0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q96MF0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q96MF0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q96MF0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q96MF0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Q96MF0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Q96MF0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Q96MF0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q96MF0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q96MF0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q96MF0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q96MF0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q96MF0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q96MF0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Q96MF0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Q96MF0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Q96MF0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms