Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GCC1Q96CN9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GCC1Q96CN9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GCC1Q96CN9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms